大掌门2的后期游戏乐趣主要集中在阵容深度培养、资源管理优化以及高难度挑战上。随着游戏进程推进，玩家需要从初期的基础养成转向精细化运营，包括弟子突破、装备觉醒、心法搭配等核心系统的深度开发。后期阵容往往围绕金色弟子或特定羁绊组合构建，例如西门吹雪与邀月的群攻体系，或李寻欢为核心的爆发流派，这些组合需要通过碎片收集和突破材料逐步成型。资源分配成为关键，平民玩家需优先保证主力弟子突破8级解锁质变技能，同时利用夺残章、华山论剑等活动获取稀有道具。
高自由度探索是后期另一大特色，皇陵活动、古墓迷阵等玩法要求玩家综合运用策略与战力。皇陵中元宝与真元的合理消耗能换取金色装备碎片，而古墓迷阵的随机事件链则需要根据弟子特性调整探索路线。跨服玩法如紫禁之巅联盟战进一步强化社交协作，宗门贡献兑换、协同挑战世界BOSS等机制让玩家在竞争与合作中持续获得成长反馈。需注意，80级后每日需预留体力参与限时副本，例如围剿奸细玩法提供的根骨修炼材料对属性提升至关重要。
装备系统的复杂性在后期凸显，甲级装备需通过师门副本、秘境探索或锻造系统获取，觉醒后的橙色装备可激活额外属性词条。心法搭配需结合弟子定位，例如防御型弟子适配减伤类心法，而输出核心优先选择增伤效果。领悟石的获取途径包括商城购买、PVP排名奖励及特殊任务，建议优先用于主力弟子的关键技能提升。气海系统提供的属性加成需通过每日5分钟的奇门遁甲玩法积累，长期投入收益显著。
后期养成节奏更注重长期规划，例如每月青龙、青衣、闯王三大活动需提前储备元宝，其中青衣活动产出金色异兽，而闯王地图分阶段购买可兑换金色武学。玩家可通过小号联动完成藏经阁任务，每日额外获取1680元宝以缓解资源压力。战力瓶颈期需调整流派，例如从闪避流转为招架流需搭配减伤真元，并通过天机阁测试阵容强度。后期玩法通过多维度的策略选择与渐进式成长设计，维持了持久的挑战性与成就感。
